Przez województwo biegną cztery międzynarodowe magistrale kolejowe: jedna rozpoczynająca się w Gdańsku – przez Szczecin do granicy z Niemcami i trzy w Gdyni – przez Warszawę i Kraków aż po granicę z Czechami i Słowacją; przez Bydgoszcz, Łódź i Katowice do zachodnich i południowych granic kraju; a także przez Olsztyn do Kaliningradu, lub przez Białystok w kierunku Białorusi. Na Pomorzu obsługiwanych jest 1350 km linii kolejowych. Gęstość sieci kolejowej należy tutaj do najwyższych w kraju. Tak ważny status metropolii i regionu na kolejowej mapie Polski wynika m.in. z faktu, że znaczna część ładunków docierających do pomorskich portów przewożona jest właśnie koleją.
Już wkrótce na wyremontowanej trasie z Gdyni przez Gdańska do Warszawy będzie jeździł nowoczesny, szybki pociąg Pendolino, który trasę pomiędzy Gdańskiem i Warszawą będzie pokonywał w niespełna 2,5 godziny.
Połączenia kolejowe Gdańska z największymi miastami w Polsce:
Gdańsk – Warszawa: około 6h
Gdańsk – Kraków: około 12h
Gdańsk – Poznań: około 4h
Gdańsk – Szczecin: około 6,5h
Gdańsk – Wrocław: około 7,5h
